La institución fue fundada el 28 de julio de 1938 en los talleres del ex Ferrocarril Urquiza, donde actualmente se levanta el imponente puente interprovincial General Manuel Belgrano, que une las ciudades de Corrientes y Resistencia. Ferroviario participó en innumerables ocasiones en los Torneos del Interior que organiza el Consejo Federal de la Asociación del Fútbol Argentino, representando a la Liga Correntina de Fútbol.
En el año 2012 Sportivo Ferroviario se fusionó con Corrientes FC para darle vida a Ferroviario Corrientes FC y hacerle frente a la Liga Correntina y luego a los Torneos Federales.
