El club nació en 1986, anotándose en LIFIPA. Fue un desprendimiento de Daga, y su primer campo estaba en 146 y 528, barrio Las Malvinas, por eso lleva el nombre del club, y además en conmemoración por los pibes caídos en las islas Malvinas.
Entre los primeros socios fundadores, Carlos Assiu ofreció de ese terreno para que los chicos jueguen, de la mano de Mario Mannarino y Pino. Hasta conseguir el predio actual, siendo propiedad de la institución, una manzana en 140 y 528, barrio Las Quintas.
Creando la cancha de 7 y cientos de pibes de los barrios tuvieron sus sábados con la azul y amarilla. Tiempo más tarde, decidieron continuar con la cancha grande con el armado de una Primera, al nivel de la Liga Amateur, hecho acontecido en 1995.
Hoy, AFI Las Malvinas ocupa un lugar en la "A" liguista, consiguiendo el ascenso en 2018.
