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Mallín Nahuén se fundó el 18 de noviembre de 1986, basando su escudo en un cultrum, instrumento musical mapuche que resulta sagrado y muy importante para el ordenamiento de sus vidas.
En su palmarés se encuentran los campeonatos de liga local en 2007 y 2022, así como también la Finalísima de 2023 ante Dep. Las Grutas. A nivel social cuenta con 200 socios aproximadamente, mientras que unos 150 jugadores componen su plantel.
